普通转录组测序检测

因业务调整，部分个人测试暂不接受委托，望见谅。

检测项目

RNA完整性检测：评估RNA降解程度，RIN值范围1-10，检测参数要求RIN≥7.0。

RNA纯度检测：测量A260/A280和A260/A230比值，参数标准A260/A280=1.8-2.0，A260/A230≥2.0。

RNA浓度检测：使用荧光法量化，检测范围0.1-1000 ng/μl，精度误差≤5%。

文库构建效率：评估cDNA合成和片段化效果，参数包括文库大小分布200-700 bp，产量≥50 ng。

测序深度控制：计算平均覆盖深度，参数要求≥30X，确保基因表达定量准确性。

映射率分析：比对reads到参考基因组的比例，参数标准≥90%，误差率≤0.1%。

基因表达定量：计算FPKM或TPM值，检测范围0-10^6，重复性相关系数≥0.95。

差异表达分析：识别差异基因，参数包括p值≤0.05，log2 fold change≥1。

剪接变异检测：鉴定可变剪接事件，参数要求支持reads数≥10，覆盖度≥80%。

新转录本鉴定：发现未注释转录本，参数包括开放阅读框预测和保守性评分≥0.7。

功能富集分析：评估基因功能类别，参数包括GO富集p值≤0.01，KEGG通路覆盖。

质量控制指标：监测测序错误率，参数如Q30百分比≥85%，碱基质量≥30。

检测范围

人类组织样本：包括新鲜或冷冻的器官如肝脏、脑组织，用于癌症研究和疾病机制探索。

动物模型样本：如小鼠、大鼠的器官或血液，支持药物毒理学和遗传学研究。

细胞培养物：包括癌细胞系或干细胞，应用于基因调控和细胞响应分析。

植物样本：如叶片、根或种子，用于作物改良和胁迫响应研究。

微生物样本：包括细菌、酵母的RNA，应用于环境微生物组和工业发酵。

临床样本：如血液、唾液或活检组织，用于诊断标志物发现和个性化医疗。

环境样本：包括土壤、水体中的RNA，研究微生物群落动态和污染响应。

药物处理样本：如化学试剂处理的细胞，评估药物效应和基因表达变化。

发育阶段样本：如胚胎或幼虫组织，支持发育生物学和时序表达分析。

疾病模型样本：如肿瘤或感染组织，用于病理机制和靶点筛选。

合成生物学产品：如工程化RNA分子，验证基因电路功能和稳定性。

食品与农业产品：如转基因作物，监测基因表达合规性和安全性。

检测标准

依据ISO 20391-1:2018进行RNA测序质量控制，规范测序深度和错误率参数。

遵循GB/T 34798-2017高通量测序技术规范，覆盖文库构建和数据分析要求。

采用ASTM E3136-18标准评估RNA完整性检测方法，确保RIN值可靠性。

参考ISO 5725-2:2019精度和重复性标准，用于基因表达定量验证。

应用GB/T 35434-2017生物信息学分析指南，规定差异表达和功能富集流程。

依据ENCODE项目标准进行映射率和剪接变异分析，确保数据可比性。

检测仪器

高通量测序仪：如NovaSeq系列，采用边合成边测序技术，通量高达20亿reads/run，用于生成原始测序数据。

生物分析仪：如Bioanalyzer系统，通过微流体芯片评估RNA完整性和文库大小，检测范围35-10000 bp。

荧光定量仪：如Qubit设备，使用荧光染料测量RNA浓度，精度达0.1 ng/μl，支持低样本量检测。

PCR扩增仪：如热循环仪，执行文库扩增步骤，温度控制精度±0.1°C，确保扩增效率。

生物信息学软件：如STAR比对工具，处理测序reads映射，支持多线程分析，功能包括变异检测。

电泳系统：如毛细管电泳仪，验证RNA片段分布，分辨率达1 bp，用于质量控制。

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件