转录组全长测序检测

因业务调整，部分个人测试暂不接受委托，望见谅。

检测项目

全长转录本覆盖率：测量RNA序列的完整度，检测参数包括覆盖深度≥30X和序列完整性≥95%

序列错误率评估：验证测序准确性，检测参数包括碱基错误率≤0.1%和质量评分Q≥30

表达量定量分析：计算基因表达水平，检测参数涉及FPKM值范围和标准化误差≤5%

可变剪接检测：识别转录本剪接变异，检测参数包含剪接位点准确度≥99%和异构体分类精度

新转录本发现：筛查未知转录序列，检测参数包括比对率≥90%和新序列验证阈值

基因融合事件分析：检测染色体重组事件，检测参数涉及融合点精确定位和置信度≥98%

GC含量分布统计：评估序列碱基组成，检测参数包括GC偏差分析和平滑系数计算

读长均匀性验证：确保序列分布均衡，检测参数涉及读长变异系数≤10%和覆盖偏差控制

RNA完整性检测：评估样本降解程度，检测参数包含RIN值≥8.0和峰型分析

重复序列过滤：移除冗余数据，检测参数涉及重复率≤5%和唯一分子标识计数

等位基因表达分析：量化单核苷酸变异影响，检测参数包括等位基因比例偏差检测

转录起始点定位：精确确定转录起始位置，检测参数涉及TSS精度≤5bp和启动子识别

检测范围

人类临床样本：包括血液、组织活检和肿瘤标本，用于疾病机制和诊断研究

植物物种组织：如水稻叶片、小麦根系和拟南芥花序，支持抗逆性和发育生物学分析

微生物培养物：涵盖细菌、真菌和酵母样本，应用于代谢途径和抗生素响应研究

癌症研究标本：包括肿瘤细胞系和原位组织，专注于驱动基因和突变图谱解析

发育生物学样品：如胚胎组织和干细胞分化模型，用于时序基因表达动态监测

环境微生物群落：涉及土壤、水体宏转录组，评估生态功能和多样性

药物响应细胞系：包含体外培养细胞模型，研究化合物诱导的转录变化

转基因生物分析：如基因编辑作物和动物模型，验证工程化转录效应

古DNA样本转录组：适用于化石和保存样本，重构灭绝物种基因表达

病毒载体系统：包括慢病毒和腺病毒载体，评估表达效率和宿主交互

免疫学研究样本：如淋巴细胞和炎症组织，分析免疫响应转录调控

神经科学样品：涵盖脑组织和神经元培养，研究神经退行性疾病机制

检测标准

依据ISO 20395标准规范RNA测序质量控制流程

遵循GB/T 37871-2019要求进行转录组数据准确性评估

采用ASTM E3136指南实施序列错误率校准

参考ISO 17205标准确保表达量定量方法一致性

应用GB/T 35536-2017规范可变剪接事件验证

遵守ISO 18115标准用于新转录本发现程序

依据ASTM F3172指南执行基因融合检测验证

参考GB/T 33864-2017进行RNA完整性检测方法

采用ISO 20166标准指导环境样本转录组分析

遵循ASTM E2520规范古DNA转录组重建流程

应用GB/T 34001-2017标准确保病毒载体系统安全性

检测仪器

长读长测序系统：利用单分子实时技术，生成全长转录本序列，功能包括高精度序列捕获和错误校正

高通量测序平台：基于合成测序原理，实现大规模并行测序，功能涵盖快速数据产出和表达量定量

便携式纳米孔测序仪：采用电信号检测机制，功能涉及野外样本即时分析和长读长覆盖

荧光定量仪：通过荧光染料绑定，功能包括RNA浓度精确测量和质量控制

微流控生物分析仪：利用电泳分离技术，功能涉及RNA完整性评估和降解程度量化

自动化样品制备系统：整合液体处理模块，功能包括文库构建标准化和污染控制

数据比对服务器：配备高性能计算单元，功能涵盖序列比对和变异检出

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件