蛋白质-蛋白质相互作用验证:验证两个目标蛋白在细胞内是否发生直接物理接触或形成复合物。
受体二聚化或寡聚化分析:检测细胞膜表面受体(如GPCR、酪氨酸激酶受体)的激活状态与聚集程度。
酶与底物相互作用:实时观测激酶、磷酸酶等酶类与其特异性底物在亚细胞区域的结合事件。
蛋白质构象变化监测:通过分子内FRET探针,检测蛋白质因配体结合、修饰或环境改变引起的构象变化。
分子间距离测量:基于FRET效率,定量测定两个标记分子在1-10纳米范围内的精确距离。
信号转导通路激活验证:追踪信号分子(如第二信使、小G蛋白)的激活状态及其下游效应物的招募。
蛋白质-DNA/RNA相互作用:研究转录因子、RNA结合蛋白与特定核酸序列在细胞核内的结合动态。
细胞器接触位点分析:检测内质网-线粒体、内质网-质膜等膜接触位点的蛋白质互作与调控。
药物靶点结合与效应评估:评估候选药物分子是否干扰或促进特定靶蛋白的相互作用,用于药物筛选。
生物分子复合物组装与解离动力学:在活细胞中实时监测多蛋白复合物的形成、稳定与解离过程。
活细胞实时成像:适用于在活体细胞中动态、无创地观测生物过程的时空变化。
固定细胞与组织切片:可用于存档的临床样本或固定后的实验样本进行回顾性分析。
细胞膜表面事件:特别擅长研究发生在质膜上的受体相互作用、内吞及信号启动。
细胞质与细胞核内事件:可深入检测胞浆内信号复合物形成及核内转录调控相互作用。
细胞器特异性互作:针对线粒体、高尔基体、内质网等特定细胞器内的蛋白质功能研究。
神经元突触结构与功能:应用于神经科学,研究突触前后蛋白的相互作用与神经递质释放。
病原体-宿主细胞相互作用:研究病毒、细菌蛋白与宿主细胞因子之间的相互作用机制。
癌症相关信号网络:聚焦于癌基因、抑癌基因产物及其信号通路的异常互作研究。
干细胞与发育生物学:用于分析决定细胞命运的关键转录因子和信号分子的互作网络。
植物细胞生物学研究:扩展至植物细胞,研究其特有的信号传导与应激反应机制。
FRET供体-受体对选择:根据光谱特性选择匹配对,如CFP/YFP、GFP/RFP或新型荧光蛋白/mCherry等。
免疫荧光标记法:使用分别耦联供体和受体荧光染料的特异性一抗或直接标记的二抗对目标蛋白进行标记。
荧光蛋白融合表达法:构建目标蛋白与荧光蛋白(如EGFP, mCherry)的融合基因,通过转染在细胞内表达。
FRET效率计算(受体光漂白法):通过漂白受体分子,测量供体荧光强度的恢复来计算FRET效率。
FRET效率计算(光谱扫描法):采集供体发射光谱和受体发射光谱,通过光谱分离算法定量分析FRET信号。
荧光寿命成像显微术(FLIM-FRET):测量供体荧光寿命的缩短,此方法不受荧光强度、浓度影响,定量更准确。
三通道图像采集与处理:依次采集供体通道、受体通道和FRET通道的图像,并进行背景扣除与校正。
图像配准与像素级分析:对多通道图像进行精确配准,并在像素或区域兴趣(ROI)水平进行FRET信号分析。
阳性与阴性对照设置:必须设置已知互作阳性对、非互作阴性对以及单标样本,以验证系统可靠性与校正串色。
统计学分析与可视化:对大量细胞的数据进行统计分析,并生成FRET效率伪彩图直观展示互作的空间分布。
激光扫描共聚焦显微镜:具备多激光线和光谱型检测器的共聚焦系统,是进行FRET成像的主流设备。
转盘式共聚焦显微镜:适用于活细胞快速、低光毒性的FRET成像,时间分辨率更高。
全内反射荧光显微镜:专用于细胞膜表面或近膜区域(约100nm内)的高信噪比FRET成像。
荧光寿命成像显微系统:集成时间相关单光子计数或频率域技术的FLIM系统,用于进行FLIM-FRET测量。
高数值孔径物镜:如60倍或100倍油浸物镜,确保高分辨率和高光子收集效率。
精确温控与气体培养系统:用于活细胞长时间成像,维持细胞正常的生理状态。
高性能科学级CCD或sCMOS相机:用于宽场FRET成像,要求具有高量子效率、低噪声和高动态范围。
可调谐激光器或LED光源:提供稳定且波长可精确选择的激发光,以匹配不同FRET对的激发需求。
光谱分光装置与检测器:如衍射光栅和32通道光谱检测器,用于采集完整发射光谱进行光谱拆分。
正规图像分析工作站与软件:配备如ImageJ(Fiji)、MetaMorph、Imaris或专用FLIM分析软件,用于图像处理与定量分析。
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