微生物群落结构测定检测

因业务调整，部分个人测试暂不接受委托，望见谅。

检测项目

16S rRNA基因测序：采用V3-V4高变区扩增，检测引物为341F/806R，测序深度≥50,000 reads/样本

ITS区域真菌分析：针对ITS1/ITS2区域扩增，引物组合ITS5/ITS4，分辨率达属水平

α多样性指数测定：包含Shannon指数（范围0-10）、Chao1指数（>95%置信区间）及Simpson指数（0-1区间）

β多样性分析：执行Bray-Curtis距离矩阵计算（精度0.001）及PCoA三维排序

物种组成谱分析：基于SILVA138数据库进行门/纲/目级分类，最低置信阈值97%

功能基因预测：应用PICRUSt2算法预测KEGG通路，置信度≥0.8

病原微生物筛查：针对沙门氏菌/大肠杆菌等设置特异性标记基因，检出限100CFU/mL

绝对定量分析：采用qPCR同步检测16S拷贝数，动态范围10²-10⁸ copies/μL

抗性基因检测：通过ARGs-OAP数据库筛查200+抗生素抗性基因，覆盖率≥90%

群落结构网络分析：构建Spearman相关性网络（|r|>0.6, p<0.01）

检测范围

环境水体微生物：涵盖地表水/地下水/废水等样品类型，检测范围10⁴-10⁸ cells/L

土壤生态系统：适用于农田/林地/荒漠等土壤样本，最低检测量0.5g干重

发酵工业体系：包括酒类/乳制品/调味品发酵菌群动态监测

人体微生态样本：肠道/口腔/皮肤菌群采样体积≥200μL

生物膜分析：针对管道/医疗器械表面生物膜，取样面积4cm²

空气微生物监测：空气采样器捕获粒径0.5-10μm颗粒物

极端环境样本：适应高盐/高温/强酸等特殊环境微生物检测

污染物降解菌群：石油烃/农药降解体系微生物组成解析

水产养殖系统：养殖水体/底泥/生物体表菌群同步检测

食品药品安全：即食食品/药品原料微生物污染溯源分析

检测标准

ISO 17764-2:2007 动物饲料脂肪酸组成分析法

ISO 4833-1:2013 食品和饲料中微生物计数通则

GB/T 38578-2020 水体微生物多样性调查技术规范

GB 4789.2-2016 食品安全国家标准 菌落总数测定

EPA/600/R-19/197 环境微生物群落表征方法指南

ASTM D4249-18 水中微生物采样标准规范

GB/T 36389-2018 高通量基因测序样本制备质量控制

ISO 17604:2015 动物胴体表面微生物取样方法

ISO 18593:2018 食品接触表面微生物采样技术

GB/T 39665-2020 微生物宏基因组测序数据分析流程

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000测序系统：双通道流动槽实现PE150测序，单次产出6Tb数据

QuantStudio 7 Pro实时荧光定量PCR仪：支持高通量384孔板，温控精度±0.1℃

MP Biomedicals FastPrep-24样品均质仪：6×4 mL管位设计，破碎速度1-12 m/s

Beckman Coulter Biomek i7自动化工作站：96通道移液臂实现核酸提取全程自动化

Agilent 4200 TapeStation生物分析仪：通过DNA ScreenTape检测片段大小（35-1000 bp）

Thermo NanoDrop One微量紫外分光光度计：检测体积0.5-2 μL，A260/A280精度±0.1

Eppendorf Centrifuge 5430R高速冷冻离心机：最大转速15,000 rpm，温控范围-20°C至40°C

Coy Laboratory厌氧操作工作站：氧浓度控制＜1 ppm，适用于严格厌氧菌处理

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件