转录组学分析检测

因业务调整，部分个人测试暂不接受委托，望见谅。

检测项目

RNA提取与纯化：基于硅胶柱或磁珠法分离总RNA，纯度参数A260/A280>1.8，浓度范围>50ng/μl，回收率>90%。

RNA完整性检测：通过电泳或自动化平台评估RIN值（RNA Integrity Number），标准范围1-10，要求>7，片段大小分布均匀。

cDNA合成：使用逆转录酶催化，反应参数包括温度42℃，时间60分钟，效率>95%，避免降解。

文库构建：片段化后加接头，片段大小200-500bp，接头连接效率>80%，文库浓度>10nM。

高通量测序：执行双端测序，测序深度≥30百万reads，读长150bp，错误率<0.1%，Q-score>30。

序列比对与映射：参考基因组比对率>80%，容许误差<2%，使用标准算法如STAR或HISAT2。

基因表达量化：计算FPKM或TPM值，灵敏度达0.1TPM，覆盖所有编码基因和非编码RNA。

差异表达分析：识别上下调基因，参数fold change≥2，p-value<0.05，FDR校正后<0.1。

功能富集分析：进行GO、KEGG通路富集，p-value<0.05，覆盖生物学过程、分子功能和细胞组分。

可变剪接检测：分析剪切事件类型（如外显子跳跃），事件数目>1000，置信度>90%。

SNP和变异鉴定：检测单核苷酸多态性，变异频率>5%，准确性>99%，覆盖全转录组。

融合基因分析：识别染色体易位事件，支持reads数>5，假阳性率<1%。

表达定量验证：通过qPCR复核，相关系数R²>0.9，变异系数<10%。

新转录本发现：de novo拼接长度>200bp，组装完整性BUSCO>80%。

检测范围

人类组织样本：包括肿瘤、器官和血液，用于癌症分子分型和疾病机制研究。

动物模型样本：如小鼠或大鼠组织，在药理毒理学和基因功能验证中应用。

植物样本：涵盖叶片、根系和种子，研究环境胁迫响应和遗传改良。

微生物群体：包括细菌、真菌群落，分析病原体转录组和抗生素耐药性。

细胞培养物：如干细胞或癌细胞系，用于细胞信号通路研究和药物筛选。

临床诊断样本：涉及体液、活检组织，支持疾病biomarker发现和个性化医疗。

环境样本：如土壤或水体微生物，监测生态毒性和生物多样性变化。

食品样本：包括肉类、蔬菜，检测食源性病原体污染和食品安全评估。

医药研发材料：在药物靶点识别和药效评价中，涵盖候选化合物处理样本。

农业生物技术产品：如转基因作物，优化产量和抗逆性状的表型关联分析。

免疫学样本：涉及淋巴细胞或血清，研究炎症反应和疫苗开发。

神经科学样本：如脑组织，探索神经退行性疾病机制和认知功能。

发育生物学样本：涵盖胚胎或组织分化阶段，分析发育时序基因调控。

检测标准

依据ISO/IEC 17025:2017实施实验室质量管理体系，确保数据可追溯性。

遵循MINSEQE指南报告高通量测序实验，包括样本制备和数据分析细节。

GB/T 34796-2017规范核酸定量方法，精度误差<5%，波长260nm。

ASTM E3135-18规定生物样本处理规程，涵盖存储温度-80℃和运输条件。

ISO 20391-1:2018定义细胞计数和质量控制参数，变异系数<15%。

GB/T 30988-2014管理RNA提取纯化流程，回收率标准>85%。

EN ISO 15216-1:2017指导微生物检测，应用于病原体转录组分析。

ISO 5725-2:2019确保检测方法精确度，偏差范围<10%。

GB/T 27404-2008规范实验室能力验证，覆盖重复性和再现性测试。

ASTM WK65021草案用于转录组数据标准化，消除批次效应。

检测仪器

高通量测序系统：执行RNA测序功能，读长150bp，通量>1TB数据/运行，支持深度分析。

实时荧光定量PCR仪：用于基因表达验证，灵敏度0.1拷贝，动态范围10⁶，确保结果复核。

生物分析仪：评估RNA完整性，分辨率1-10000nt，输出RIN值，质量控制核心设备。

分光光度计：测量核酸浓度，波长范围190-800nm，精度±5%，样本处理基础工具。

高速离心机：样本制备功能，转速>15000rpm，离心力>20000g，保障RNA纯化效率。

自动化液体处理系统：执行试剂分配，精度0.1μl，减少人为误差，提升通量。

服务器集群：生物信息学分析功能，计算能力>100TFLOPS，运行比对和量化算法。

冷冻储存设备：样本保存，温度-80℃，稳定性>5年，防止RNA降解。

电泳系统：可视化RNA片段，电压范围50-300V，分辨率高，完整性初筛工具。

酶标仪：检测浓度和纯度，波长精度±1nm，高通量样本筛查设备。

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件