染色体核型分析:通过显微镜观察染色体的数目与结构,用于诊断唐氏综合征、特纳综合征等染色体病。
染色体微阵列分析:高通量检测染色体亚显微水平的缺失或重复,是智力障碍、多发畸形的一线检测方法。
全外显子组测序:对全部约2万个基因的编码区进行测序,用于表型复杂、疑似单基因病的病因查找。
全基因组测序:对个体全部基因组DNA进行测序,能同时检测编码区、非编码区及结构变异,是终极的基因组分析工具。
靶向基因包测序:针对特定疾病或表型相关的基因组合进行测序,如遗传性肿瘤基因包、神经肌肉病基因包等。
线粒体基因组测序:对线粒体DNA全长进行测序,用于诊断线粒体脑肌病、Leber遗传性视神经病变等。
动态突变检测:专门检测如亨廷顿病、脆性X综合征等由三核苷酸重复序列异常扩展引起的疾病。
单基因病Sanger测序验证:作为金标准,对NGS检测出的疑似致病位点进行精准验证。
遗传性耳聋基因检测:检测GJB2、SLC26A4等常见耳聋相关基因,用于病因诊断与新生儿筛查。
药物基因组学检测:分析与药物代谢、疗效和毒性相关的基因变异,指导个体化用药。
染色体数目异常:包括非整倍体(如21三体、18三体)和整倍体改变,导致严重的发育异常。
染色体结构异常:包括缺失、重复、倒位、易位等,可导致发育迟缓、智力障碍或自然流产。
单基因遗传病:遵循孟德尔遗传规律,如地中海贫血、血友病、杜氏肌营养不良、遗传性代谢病等。
线粒体遗传病:由线粒体DNA突变引起,表现为母系遗传,如MELAS综合征、Leigh综合征等。
基因组印记疾病:由于基因的亲源特异性表达异常导致,如Prader-Willi综合征、Angelman综合征。
动态突变疾病:由DNA中特定短序列重复次数过度扩展引起,如脊髓小脑性共济失调、肌强直性营养不良。
遗传性肿瘤综合征:由胚系突变导致肿瘤易感性显著增高,如遗传性乳腺癌卵巢癌综合征、林奇综合征。
先天性畸形与发育障碍:包括先天性心脏病、神经管缺陷、智力障碍/发育迟缓、自闭症谱系障碍的遗传学病因。
遗传性心血管疾病:如家族性高胆固醇血症、肥厚型心肌病、长QT综合征等。
遗传性神经肌肉病:包括遗传性周围神经病、肌病、运动神经元病、遗传性癫痫等。
G显带核型分析:经典的细胞遗传学技术,使用吉姆萨染色使染色体呈现特征性带纹,用于分析宏观结构异常。
荧光原位杂交:利用荧光标记的核酸探针与靶序列杂交,在细胞核或染色体上定位特定DNA序列。
微阵列比较基因组杂交:将待测DNA与对照DNA用不同荧光标记,竞争性杂交到芯片探针上,检测拷贝数变异。
单核苷酸多态性微阵列:通过检测全基因组数十万个SNP位点的信号强度,推断拷贝数变化和杂合性缺失。
Sanger测序:双脱氧链终止法,准确率高,是验证基因序列变异的金标准,但通量较低。
下一代测序:高通量并行测序技术,能一次性对数百万到数十亿条DNA分子进行测序,包括WES、WGS、Panel测序等。
多重连接依赖性探针扩增:用于检测特定基因或基因组区域的外显子水平缺失/重复,技术相对简便快捷。
实时荧光定量PCR:通过监测PCR反应过程中的荧光信号,对特定DNA序列进行定量分析,常用于验证CNV或检测突变负荷。
片段分析:利用毛细管电泳分离不同长度的PCR产物,用于检测动态突变、小片段插入缺失等。
数字PCR:将样本分割成大量微反应单元进行独立PCR,实现绝对定量,用于低比例嵌合体、拷贝数精确定量等。
全自动染色体扫描系统:集成自动进片、寻核、拍照和图像分析,极大提高核型分析效率。
荧光显微镜:配备特定激发/发射滤光片组和CCD相机,用于观察FISH、免疫荧光等实验结果。
微阵列芯片扫描仪:高分辨率的激光共聚焦扫描仪,用于读取芯片杂交后的荧光信号图像。
基因分析仪:基于毛细管电泳原理,用于Sanger测序、片段分析和STR检测。
高通量测序仪:如Illumina NovaSeq、HiSeq系列,Life Ion Torrent系列等,是进行NGS的核心设备。
实时荧光定量PCR仪:集成温控、光学检测和数据分析系统,用于基因表达、拷贝数分析和突变检测。
数字PCR仪:包括微滴式或芯片式系统,能够实现核酸分子的绝对定量,灵敏度极高。
核酸提取纯化工作站:自动化完成样本裂解、核酸结合、洗涤和洗脱,保证核酸质量与实验一致性。
超声打断仪:利用超声波或物理剪切将基因组DNA随机打断成特定大小的片段,是文库制备的关键步骤。
生物信息学分析服务器/集群:高性能计算系统,用于存储、处理和分析海量的基因组测序数据。
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