岩藻肽绝对定量分析:利用已知浓度的同位素标记标准品,建立标准曲线,实现对目标岩藻肽在复杂样品中的绝对含量测定。
目标肽段相对定量分析:通过比较轻标和重标肽段的质谱信号强度,计算不同样品中同一岩藻肽的相对丰度变化。
代谢动力学研究:追踪同位素标记岩藻肽在生物体内的吸收、分布、代谢和排泄过程,获取其药代动力学参数。
蛋白质组学定量分析:在蛋白质组尺度上,通过标记酶解后的肽段,实现对含岩藻糖基化位点蛋白质的差异表达分析。
岩藻糖基化位点鉴定:利用标记肽段的特征碎片离子,精确鉴定岩藻肽中岩藻糖基化的具体氨基酸位点。
结构异构体区分:借助高分辨质谱和标记技术,区分岩藻糖连接方式(如α-1,2, α-1,3, α-1,4连接)不同的肽段异构体。
相互作用蛋白筛选:将标记岩藻肽作为分子探针,通过亲和纯化结合质谱分析,筛选其在细胞内的相互作用蛋白。
酶活性测定:利用标记底物,测定岩藻糖苷酶或岩藻糖基转移酶的活性,研究相关酶的催化特性。
生物合成途径追踪:使用稳定同位素标记的前体物质,追踪岩藻肽在生物体内的生物合成途径与代谢流向。
稳定性与降解研究:评估同位素标记岩藻肽在不同生理环境(如pH、温度、酶存在下)的稳定性及降解产物。
海洋生物样品:包括海带、裙带菜、马尾藻等多种褐藻及其提取物中的天然岩藻肽。
化学合成岩藻肽:通过固相或液相方法合成的、结构明确的岩藻糖基化肽段及其类似物。
酶解产物:岩藻糖基化蛋白经特异性或非特异性蛋白酶(如胰蛋白酶)酶解后产生的含岩藻糖肽段混合物。
细胞裂解液:经过或未经过岩藻肽处理的细胞,其全细胞裂解液中的内源性及外源性岩藻肽。
动物组织与体液:如给药后的动物血清、血浆、尿液、肝脏、肠道组织等生物样本。
体外反应体系:包含酶、底物和辅因子的体外酶促反应液,用于研究岩藻肽的生成或修饰过程。
药物制剂:以岩藻肽为主要活性成分的药物或功能性食品制剂。
培养上清液:能够分泌或修饰岩藻肽的微生物或细胞培养物的上清液。
环境样本:特定海洋环境(如藻华区域)水样或沉积物中可能存在的微生物源岩藻肽。
质量控制样品:用于方法验证的加标回收样品、空白对照样品和质控对照样品。
SILAC(稳定同位素氨基酸标记):在细胞培养过程中引入重标氨基酸,使新合成的岩藻糖基化蛋白/肽段带有质量标签。
化学标记法(如iTRAQ/TMT):利用同位素编码的化学标签,对样品酶解后的肽段(包括岩藻肽)进行标记,实现多组平行比较。
AQUA绝对定量法:合成与目标岩藻肽序列完全相同但含有重标氨基酸(如13C/15N标记的赖氨酸或精氨酸)的合成肽作为内标。
代谢标记法:使用含有稳定同位素(如13C)的岩藻糖或前体分子喂养细胞或生物体,实现对新合成岩藻肽的特异性标记。
液相色谱-串联质谱法:核心分析方法,通过LC分离标记与非标记肽段,MS/MS进行定性与定量检测。
多反应监测/平行反应监测:基于三重四极杆或高分辨质谱的靶向定量方法,选择性监测标记岩藻肽的特征母离子和子离子对。
数据依赖性采集:非靶向扫描模式,自动选择强度最高的离子(包括标记离子)进行碎裂,用于发现性研究。
数据非依赖性采集:对设定质荷比窗口内的所有离子进行无偏碎裂,特别适合复杂样品中低丰度标记岩藻肽的全面检测。
亲水相互作用色谱法:利用HILIC模式高效分离强极性的岩藻糖基化肽段与非糖基化肽段,提高检测灵敏度。
电子转移解离/高能碰撞解离碎裂:应用ETD或HCD等碎裂技术,有效保留糖苷键,获得丰富的糖链及肽段骨架信息用于定位。
高分辨液相色谱仪:用于复杂生物样品中岩藻肽的高效、高分离度分离,常与质谱联用。
三重四极杆质谱仪:进行MRM靶向定量分析的核心设备,具有高灵敏度和宽线性动态范围。
轨道阱系列高分辨质谱仪:如Orbitrap Exploris或Fusion系列,提供超高分辨率和质量精度,用于精确鉴定和PRM定量。
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪:用于快速筛查标记岩藻肽的分子量及初步纯度鉴定。
纳升液相色谱系统
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