C-反应蛋白(CRP)mRNA:经典的急性期反应蛋白,其基因表达水平是评估急性炎症和组织损伤的灵敏指标。
血清淀粉样蛋白A(SAA)mRNA:在急性期反应中浓度急剧升高,对病毒感染和某些慢性炎症具有重要提示意义。
α1-酸性糖蛋白(AGP)mRNA:一种主要的急性期反应蛋白,其水平升高与炎症活动度密切相关。
结合珠蛋白(HP)mRNA:在溶血和炎症状态下表达上调,有助于评估炎症程度和血管内溶血。
纤维蛋白原(FIB)mRNA:不仅是凝血因子,也是重要的急性期反应蛋白,其表达反映炎症和应激状态。
补体C3 mRNA:补体系统关键成分,在急性期反应中合成增加,参与免疫防御和炎症反应。
白细胞介素-6(IL-6)mRNA:关键的促炎细胞因子,是诱导肝脏产生急性期反应蛋白的主要调节因子。
肿瘤坏死因子-α(TNF-α)mRNA:重要的炎症介质,在急性期反应的启动中发挥核心作用。
降钙素原(PCT)mRNA:在严重细菌感染和脓毒症时特异性高表达,是鉴别细菌感染的重要分子标志物。
脂多糖结合蛋白(LBP)mRNA:参与机体对革兰氏阴性菌感染的识别与应答,其表达水平与内毒素血症相关。
细菌与病毒感染鉴别诊断:通过PCT、CRP等基因表达谱的差异,辅助区分细菌性和病毒性感染。
脓毒症与全身炎症反应综合征(SIRS)监测:动态监测多种急性期反应基因,评估全身性感染的严重程度和预后。
自身免疫性疾病活动度评估:如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等疾病活动期的炎症水平监测。
手术后感染与并发症预警:术后早期检测相关基因表达变化,预警手术部位感染或全身并发症。
创伤及烧伤后应激反应评估:量化机体在严重创伤或烧伤后的急性期反应强度。
心血管疾病风险预测:检测如CRP等低水平慢性炎症标志物基因表达,评估动脉粥样硬化等心血管风险。
肿瘤相关恶病质与炎症状态监测:评估肿瘤患者体内的系统性炎症反应,与恶病质发生发展相关。
器官移植后排异反应监测:作为非特异性炎症指标,辅助判断移植后的急性排斥反应。
药物疗效评价:通过治疗前后急性期反应基因表达量的变化,客观评价抗炎或免疫抑制药物的疗效。
基础医学研究:用于研究急性期反应的分子调控机制、信号通路及新标志物的发现。
样本采集与处理:采集全血、血清、血浆或特定组织,使用PAXgene管等专用容器保存RNA,防止降解。
总RNA提取:采用柱式法或磁珠法从样本中高效提取高纯度、完整性好的总RNA。
RNA浓度与纯度测定:使用微量分光光度计测定RNA在260nm/280nm处的吸光度值,评估浓度和纯度。
逆转录合成cDNA:以提取的总RNA为模板,利用逆转录酶和随机引物或Oligo(dT)引物合成第一链cDNA。
实时荧光定量PCR引物/探针设计:针对目标基因的保守区域,设计特异性引物和TaqMan探针或SYBR Green兼容引物。
qPCR反应体系配制:将cDNA模板、特异性引物/探针、荧光染料或探针、DNA聚合酶及缓冲液精确混合。
实时荧光定量PCR扩增:将反应体系置于实时荧光定量PCR仪中,进行热循环扩增并实时采集荧光信号。
标准曲线绘制与定量分析:使用已知浓度的标准品梯度稀释后同时扩增,绘制标准曲线,据此计算未知样本中目标基因的绝对或相对表达量。
内参基因校正:选用GAPDH、β-actin等持家基因作为内参,对目标基因的表达量进行归一化处理,消除样本间差异。
数据分析与报告生成:使用仪器配套软件分析Ct值或荧光增长曲线,计算基因表达差异倍数,生成标准化检测报告。
实时荧光定量PCR仪:核心设备,用于进行DNA扩增并实时监测荧光信号变化,如ABI QuantStudio系列、Bio-Rad CFX系列等。
核酸提取仪:自动化完成样本的裂解、结合、洗涤和洗脱步骤,实现高通量、标准化的RNA提取。
微量分光光度计/纳米滴度计:用于快速、微量地检测所提取RNA的浓度和纯度,仅需1-2μL样本。
高速冷冻离心机:用于样本预处理、RNA提取过程中的离心步骤,确保沉淀完全和相分离。
超净工作台/生物安全柜:提供无菌无尘的操作环境,防止样本污染并保护操作人员安全。
涡旋振荡器:用于快速混匀微量离心管中的液体反应体系,确保反应成分均匀分布。
微量移液器及无菌吸头:精确移取微量液体(μL至mL级别)的关键工具,需定期校准以保证准确性。
PCR板/管密封仪:用于在qPCR反应前对96孔板或8联管进行光学膜热密封,防止蒸发和污染。
-80°C超低温冰箱:用于长期保存提取的RNA、cDNA及引物探针等关键试剂,保证其稳定性。
数据分析计算机及软件:安装仪器配套的正规分析软件(如QuantStudio Design & Analysis),用于运行设置、数据采集和结果分析。
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