单细胞蛋白质组学

检测项目

蛋白质表达谱分析：在单细胞水平上全面鉴定和定量数千种蛋白质，构建细胞特异性蛋白质表达图谱。

翻译后修饰分析：检测单个细胞中蛋白质的磷酸化、乙酰化、泛素化等修饰状态，解析信号通路动态。

蛋白质相互作用网络：通过邻近标记等技术，推断单细胞内蛋白质之间的相互作用关系。

细胞表面蛋白质组：特异性分析细胞膜表面的蛋白质，用于免疫分型、受体研究及药物靶点发现。

信号通路活性分析：通过关键信号蛋白及其修饰的定量，评估特定信号通路在单个细胞中的激活水平。

细胞周期相关蛋白分析：鉴定与细胞周期进程相关的标志蛋白，研究单个细胞的增殖状态。

细胞应激与凋亡标志物：检测热休克蛋白、凋亡相关蛋白等，评估单个细胞的应激反应和生存状态。

代谢酶与代谢状态：分析参与糖酵解、三羧酸循环等关键代谢途径的酶，推断单细胞的代谢表型。

转录因子与核蛋白分析：富集并鉴定调控基因表达的转录因子及核内蛋白质。

分泌蛋白与细胞因子分析：通过特殊技术捕获和分析单个细胞分泌或胞外囊泡携带的蛋白质。

检测范围

免疫细胞亚群分析：深入解析T细胞、B细胞、巨噬细胞等免疫细胞在肿瘤微环境或感染中的功能异质性。

肿瘤异质性研究：揭示肿瘤内部不同细胞亚群在蛋白质表达上的差异，寻找耐药细胞和驱动克隆。

干细胞与发育生物学：追踪胚胎发育或组织再生过程中，干细胞分化为不同谱系细胞的蛋白质动态变化。

神经科学：研究复杂脑组织中不同神经元和胶质细胞类型的蛋白质组成，理解神经退行性疾病机制。

临床诊断与精准医疗：从稀有临床样本（如循环肿瘤细胞、穿刺活检）中获取蛋白质信息，辅助疾病分型和用药指导。

药物开发与筛选：在单细胞水平评估药物对靶点蛋白的作用效果及细胞的异质性响应。

微生物学研究：分析细菌群体中单个细胞的蛋白质表达，研究其对抗生素的耐受性等表型差异。

植物科学：应用于植物不同组织或胁迫条件下的单细胞蛋白质组分析，研究抗逆机制。

空间蛋白质组学整合：与成像技术结合，在保留空间位置信息的前提下分析组织内单细胞的蛋白质组。

多组学联合分析：与单细胞转录组、表观组数据进行整合，实现从基因到蛋白质的多层次生命过程解读。

检测方法

质谱流式技术(CyTOF)：使用金属同位素标记抗体，通过质谱检测实现单细胞表面和胞内蛋白的高通量多参数检测。

单细胞质谱(SCoPE-MS, plexDIA)：基于液相色谱-质谱联用，通过等重同位素标记或数据非依赖采集策略对大量单细胞进行深度蛋白质组分析。

微流控芯片技术：利用纳升级别微腔室或液滴系统分离单个细胞，进行自动化裂解、消化和前处理，提高通量和重复性。

抗体条形码技术(如CITE-seq, REAP-seq)：将寡核苷酸序列与抗体偶联，通过测序读取蛋白表达信息，可与转录组同时测量。

邻近延伸分析(PEA)：使用一对DNA偶联的抗体结合靶蛋白，通过邻近杂交引发DNA扩增，实现超高灵敏度的蛋白检测。

免疫荧光成像(如Cyclic IF)：通过多轮抗体染色与洗脱的循环，在单细胞原位实现数十种乃至上百种蛋白的可视化与定量。

单细胞Western Blot：在微流控芯片上对大量单细胞并行进行电泳分离和免疫检测，可分析蛋白分子量信息。

基于DNA模板的蛋白检测：如Proximity Ligation Assay (PLA)，通过DNA连接与扩增放大信号，用于检测低丰度蛋白或相互作用。

单细胞酶活性分析：使用荧光底物或活性探针，在活细胞内实时检测特定酶的催化活性。

表面等离子体共振成像(SPRi)：无标记实时监测单个活细胞表面蛋白质与配体相互作用的动力学过程。

检测仪器设备

飞行时间质谱流式仪(CyTOF)：核心设备，利用电感耦合等离子体质谱检测金属标签，实现超过40参数的同步测量。

高灵敏度液相色谱-串联质谱仪(LC-MS/MS)：如Orbitrap Eclipse, timsTOF SCP等，具备超高灵敏度和扫描速度，用于深度单细胞蛋白质组学。

微流控单细胞制备系统：如10x Genomics Chromium系统（适配蛋白质组）、CellenONE等，用于高通量单细胞分离与封装。

下一代测序仪(NGS)：用于读取基于抗体条形码或PEA等技术的蛋白质信号，实现多组学整合分析。

高内涵成像系统：配备自动显微镜和图像分析软件，用于基于成像的单细胞蛋白质组学分析。

单细胞分选仪：如荧光激活细胞分选仪(FACS)或微流控分选仪，用于根据特定标记预分选目标单细胞群体。

纳升液相色谱系统(nanoLC)：为单细胞级别的极微量样品提供高效分离，是连接前端处理与质谱的关键部件。

自动化液体处理工作站：实现单细胞样品前处理（如裂解、消化、标记）的自动化、标准化和微量操作。

超高分辨率显微镜：如STORM/PALM，用于单分子水平蛋白质定位和共定位研究，提供空间信息。

数据处理与生物信息学服务器集群：配备高性能计算单元和存储，用于处理海量的单细胞蛋白质组学原始数据并进行复杂分析。

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件