1. MSI-H(Microsatellite Instability High):表示微卫星区域存在高度不稳定性,通常与肿瘤发生和进展有关。
2. MSI-L(Microsatellite Instability Low):表示微卫星区域存在低度不稳定性,可能与某些特定类型的癌症相关。
3. MSS(Microsatellite Stability):表示微卫星区域稳定性正常,通常与非MSI癌症类型相关。
4. MMR(Mismatch Repair):评估DNA修复机制的完整性,是MSI检测的核心。
5. MLH1表达水平:MLH1基因的表达水平与MSI状态密切相关。
6. PMS2表达水平:PMS2基因的表达水平也是评估MSI状态的重要指标。
7. MSH2表达水平:评估MSH2基因的表达水平有助于确定MSI状态。
8. MSH6表达水平:MSH6基因的表达水平对于MSI检测同样具有重要意义。
9. Biallelic Mutations:检查肿瘤细胞中是否存在两个等位基因的突变,以确定MSI状态。
10. Allele Loss:评估肿瘤细胞中是否存在微卫星区域的等位基因丢失现象。
1. 肿瘤组织:用于评估肿瘤内部的微卫星稳定性。
2. 血液样本:通过血液中的循环肿瘤DNA(ctDNA)进行MSI检测,适用于无法获取肿瘤组织的情况。
3. 唾液样本:唾液样本可用于家庭遗传性癌症风险评估和早期筛查。
4. 粪便样本:通过粪便中的ctDNA进行非侵入性癌症筛查。
5. 胸水、腹水样本:用于评估转移性或晚期癌症患者的微卫星稳定性。
6. 骨髓样本:在血液系统恶性肿瘤中进行MSI检测以指导治疗决策。
7. 淋巴结样本:评估淋巴结转移性肿瘤的微卫星稳定性。
8. 肿瘤边缘组织样本:用于确定肿瘤边界内的微卫星稳定性,以指导手术切除范围。
9. 肿瘤周围正常组织样本:对比分析正常组织与肿瘤组织之间的微卫星稳定性差异。
10. 多个组织样本组合分析:综合多个不同组织部位的样本进行综合评估,提高诊断准确性。
1. PCR-SSCP(Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism):通过PCR扩增后进行SSCP分析,识别微卫星区域的构象变化。
2. PCR-RFLP(Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism):利用限制性内切酶切割PCR产物,分析片段长度变化来判断微卫星稳定性。
3. PCR-SSO(Polymerase Chain Reaction-Specific Single Primer Oligonucleotide):使用特异性引物对进行PCR扩增后分析单个等位基因的变化情况。
4. PCR-STR(Polymerase Chain Reaction-Short Tandem Repeat):通过PCR扩增STR序列并进行电泳分析,识别重复单位数量的变化。
5. NGS(Next Generation Sequencing):利用高通量测序技术全面分析微卫星区域变异情况,提供更精确的MSI状态判断依据。
6. qPCR(Quantitative Polymerase Chain Reaction)结合熔解曲线分析或芯片技术识别特定等位基因的变化情况。
7. FISH(Fluorescence In Situ Hybridization)结合荧光标记探针识别染色体上的等位基因丢失现象。
8. IHC(Immunohistochemistry)结合抗体识别特定蛋白表达水平的变化情况。
9. RT-qPCR(Reverse Transcription Quantitative Polymerase Chain Reaction)结合逆转录反应识别特定基因转录活性的变化情况。
10. CRISPR-Cas9技术结合高通量测序技术对特定基因突变情况进行精准鉴定。
1. PCR仪/扩增仪 - 用于PCR反应过程中的温度控制和时间管理。
2. 电泳仪 - 用于STR序列电泳分析和片段长度变化观察。
3. 高通量测序仪 - 用于NGS方法中的大规模序列读取和变异分析。
4. FISH荧光显微镜 - 结合荧光标记探针进行染色体定位和等位基因丢失观察。
5. IHC免疫组化仪 - 结合抗体进行蛋白质表达水平的定量分析。
6. RT-qPCR仪 - 结合逆转录反应和实时荧光定量技术进行基因转录活性测定。
7.CRISPR-Cas9操作平台 - 结合CRISPR-Cas9系统实现精准基因编辑和突变鉴定。
8.NGS文库制备系统 - 用于高通量测序前文库构建过程中的质量控制和标准化操作。
1、咨询:提品资料(说明书、规格书等)
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4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)
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6、检测出相关数据,编写报告草件,确认信息是否无误
7、确认完毕后出具报告正式件
8、寄送报告原件
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