脱靶效应高通量分析

检测项目

全基因组脱靶位点预测分析：基于生物信息学算法对基因编辑系统进行全基因组范围的潜在脱靶位点扫描与预测，识别与靶序列相似度高的同源区域。

体外切割活性检测：在无细胞体系中评估基因编辑工具对预测脱靶序列的切割效率，量化其非特异性核酸酶活性。

细胞水平脱靶效应验证：在活细胞模型中通过高通量测序技术直接检测实际发生的脱靶编辑事件，确认预测位点的真实性。

脱靶突变类型鉴定：对鉴定出的脱靶位点进行深度测序分析，精确识别插入、缺失、碱基替换等不同类型的基因突变。

脱靶频率统计分析：计算每个脱靶位点的编辑频率，评估脱靶事件发生的统计显著性及其生物学意义。

染色质开放性影响评估：分析染色质三维结构及开放状态对脱靶效应的影响，研究表观遗传因素与脱靶活性的关联性。

向导RNA特异性评估：系统评估向导RNA的序列设计对其特异性的影响，包括种子区长度、二级结构及GC含量等参数。

长期脱靶效应追踪：在细胞传代或动物模型中长期追踪观察脱靶效应的稳定性与动态变化规律。

非同源末端连接修复分析：研究DNA双链断裂后通过NHEJ通路修复过程中引入的突变特征与脱靶效应的关系。

同源定向修复准确性评估：在存在供体模板的情况下，评估HDR修复过程的保真度及在脱靶位点引发错误修复的风险。

全转录组 off-target 效应筛查: 扩展检测范围至转录组水平，评估基因编辑工具对RNA分子的潜在非特异性编辑活性。

检测范围

Crispr-Cas9基因编辑系统: 涵盖SpCas9, SaCas9等多种Cas核酸酶及其变体在不同细胞类型中的应用安全性评估。

Crispr-Cas12系列编辑器: 针对Cas12a, Cas12b等具有不同PAM序列识别特性的基因编辑工具的脱靶特性分析。

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件