Edman降解测序：一种经典的N端序列分析方法，通过苯异硫氰酸酯与氨基酸残基的逐步反应和切割，实现对蛋白质或多肽N端序列的依次测定。
质谱法N端分析：利用高分辨率质谱技术对酶解或化学修饰后的N端肽段进行质量分析，从而推断出N端的氨基酸序列信息。
荧光标记测序：采用荧光试剂对蛋白质的N端氨基进行特异性标记，通过检测荧光信号的变化来解读N端的氨基酸顺序。
氨基末端封闭分析：检测蛋白质N端氨基是否被乙酰化、甲酰化等化学基团封闭，评估翻译后修饰对蛋白质功能的影响。
从头测序验证：结合质谱数据和生物信息学算法，在不依赖数据库的情况下直接解析蛋白质或多肽的完整N端序列。
定量N端组学分析：通过同位素标记或非标记定量技术，比较不同样品中N端肽段的丰度差异，用于研究蛋白质加工和降解过程。
二硫键定位与N端关联分析：在测定N端序列的同时，确定二硫键的位置，分析其与蛋白质N端结构域的构象关系。
突变体N端序列确认：对重组或突变蛋白质的N端序列进行测定，验证其表达产物是否与预期设计的氨基酸序列一致。
糖基化修饰位点鉴定：鉴定位于或邻近N端的糖基化修饰位点，分析糖链结构对蛋白质稳定性和活性的作用。
蛋白水解加工过程的影响。
