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发布时间:2025-08-12
关键词:成脂相关miRNA测序测试仪器,成脂相关miRNA测序测试机构,成脂相关miRNA测序测试周期
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来源:北京中科光析科学技术研究所
因业务调整,部分个人测试暂不接受委托,望见谅。
miRNA提取效率检测:评估生物样本中微小RNA的分离效果;具体检测参数包括浓度测定(ng/μl)、纯度(A260/A280比值)、完整性指数(RIN值)。
高通量测序文库构建:制备用于测序的cDNA文库;具体检测参数包括文库大小(150-300 bp范围)、浓度(nM单位)、接头连接效率(%覆盖率)。
测序深度与覆盖度分析:确保序列数据的全面性;具体检测参数包括reads数量(百万级)、平均覆盖倍数、目标区域覆盖百分比。
miRNA表达定量:计算个体miRNA的表达水平;具体检测参数如reads per million mapped reads (RPM)、标准化因子(TMM或DESeq2)。
差异表达分析:识别成脂相关miRNA的表达变化;具体检测参数包括fold change阈值(≥2倍)、统计显著性(p值<0.05)、错误发现率(FDR校正)。
靶基因预测:推断miRNA的潜在作用目标;具体检测参数使用算法评分阈值(如TargetScan context score >0.5)、结合位点保守性评估。
功能富集分析:揭示靶基因的生物学意义;具体检测参数包括Gene Ontology富集分析(q值<0.1)、KEGG通路富集度(富集因子>1.5)。
定量PCR验证:独立确认测序结果可靠性;具体检测参数如Ct值范围、相对表达量计算(2^-ΔΔCt方法)。
样本质量控制:评估输入材料适用性;具体检测参数包括RNA降解程度(28S/18S比值)、污染物检测(DNA残留率<5%)。
生物信息学流程评估:监控数据处理质量;具体检测参数包括比对率(>90%)、重复序列率(<20%)、错误率(<0.1%)。
序列变异检测:筛查miRNA突变或编辑;具体检测参数包括单核苷酸变异频率阈值(≥5%)、编辑位点鉴定。
表达相关性分析:研究miRNA与成脂标志物关联;具体检测参数如皮尔逊相关系数(绝对值>0.7)、聚类分析参数。
脂肪组织活检样本:人类或动物模型的脂肪样本,用于体内脂肪形成机制研究。
脂肪细胞培养模型:体外诱导干细胞分化的脂肪细胞,模拟成脂过程。
血液循环样本:全血或血清样本,分析代谢疾病中的循环miRNA表达。
肥胖研究模型:遗传性或饮食诱导肥胖动物的脂肪组织样本。
糖尿病相关样本:糖尿病动物模型或患者的胰腺及脂肪样本。
营养干预实验样本:饮食调控后的细胞或组织样本,研究营养因子影响。
药物研发样本:测试化合物对miRNA表达作用的细胞培养物。
干细胞分化样本:多能干细胞定向分化为脂肪细胞的各阶段材料。
基因编辑模型:CRISPR技术修饰的细胞或组织,探索基因功能。
临床队列样本:大规模人群研究的脂肪或血液样本,用于流行病学分析。
代谢器官交叉样本:肝脏或肌肉组织,研究器官间调控网络。
动物模型脂肪库:小鼠、大鼠等常见模型的皮下或内脏脂肪样本。
ISO 20395:2019 生物技术-高通量测序的质量控制要求。
GB/T 33682-2017 高通量测序数据质量控制通用要求。
ISO/IEC 17025:2017 测试和校准实验室能力的通用要求。
ASTM E2677-2014 基因表达谱分析的标准指南。
GB/T 30999-2014 人类生物样本库基本要求。
MIAME标准 基因表达数据报告最小信息规范。
MINSEQE标准 测序实验最小信息报告准则。
EN ISO 15189:2012 医学实验室质量和能力要求。
高通量测序平台:用于生成miRNA序列数据;在本检测中执行深度测序,产生原始reads文件。
核酸提取系统:高效分离微小RNA分子;具体功能为从组织或细胞中纯化高质量RNA。
文库制备自动化工作站:构建测序文库;功能包括RNA片段化、末端修复和接头连接。
实时荧光定量PCR系统:验证特定miRNA表达水平;功能为测定Ct值并计算差异表达。
生物信息学分析服务器:处理大规模测序数据;功能包括序列比对、表达定量和差异分析。
电泳装置:评估RNA完整性;功能为检测降解程度,确定样本适用性。
冷冻离心设备:处理低温敏感样本;功能为分离样本组分并维持稳定性。
微量分光光度计:测量核酸浓度;功能为量化提取的miRNA浓度和纯度。
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4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)
5、收到样品,安排费用后进行样品检测
6、检测出相关数据,编写报告草件,确认信息是否无误
7、确认完毕后出具报告正式件
8、寄送报告原件