单细胞转录组测试检测

因业务调整，部分个人测试暂不接受委托，望见谅。

检测项目

细胞捕获效率：测量样本中成功捕获的细胞比例，参数包括捕获率阈值大于85%，使用微流控技术确保单细胞隔离。

基因表达丰度：量化单个细胞中的基因表达水平，参数涉及FPKM值计算范围0.1-100000，支持差异基因鉴定。

细胞类型鉴定：识别不同细胞亚群，参数包括聚类分析K值设置3-20，基于基因表达标记进行自动分类。

批次效应校正：减少实验间变异，参数采用RUVs或ComBat方法，变异系数小于15%。

差异基因表达分析：比较组间表达差异，参数设置log2 fold change阈值大于1.5，假发现率FDR小于0.05。

RNA完整性：评估RNA质量，参数要求RIN值达到7以上，使用电泳分析确保无降解。

库复杂度：衡量测序文库多样性，参数包括测序饱和度指标大于80%，避免数据偏差。

细胞存活率：检测样本中活细胞比例，参数设定大于90%，通过台盼蓝染色法精确测量。

污染控制：监控外源RNA污染，参数涉及reads映射率大于95%，确保数据纯净性。

数据质量控制：评估原始数据准确性，参数要求Q30分数大于85%，覆盖深度30x以上。

转录本定量：计算基因表达量，参数采用UMI计数技术，误差率小于2%。

可变剪接分析：识别剪接变异，参数包括junction reads覆盖率大于50%，支持异构体检测。

检测范围

癌症研究：分析肿瘤微环境细胞异质性，应用于肺癌、乳腺癌等样本的转录组图谱构建。

神经科学：研究脑组织细胞类型分布，用于阿尔茨海默症或帕金森病模型的单细胞表达解析。

免疫学：探索免疫细胞亚型功能，适用于T细胞、B细胞的激活状态评估。

发育生物学：追踪胚胎发育轨迹，用于干细胞分化过程中的基因表达动态监测。

药物筛选：评估化合物对细胞的影响，应用于抗癌药物响应测试的高通量分析。

干细胞研究：表征多能干细胞状态，用于iPSC重编程效率的转录组验证。

传染病学：分析宿主-病原体互动，适用于病毒感染细胞的基因表达变化检测。

个性化医疗：定制治疗方案，用于患者样本的预后标志物发现。

环境毒素影响：研究污染物暴露效应，应用于重金属或化学物对细胞转录组的扰动分析。

植物科学：解析植物细胞功能，用于作物抗逆性基因的表达谱研究。

心血管疾病：检测心脏组织细胞异常，应用于心肌梗死模型的基因调控网络分析。

衰老研究：探索细胞衰老机制，用于端粒酶活性相关的表达变化监测。

检测标准

依据ISO 20391标准进行细胞计数和活力测定，确保单细胞分离准确性。

GB/T 36755规范基因表达分析流程，涵盖RNA提取和文库制备步骤。

ASTM E2696标准指导测序数据质量控制，包括序列比对和错误率控制。

ISO 10993标准适用于生物样本处理，保障细胞培养和存储安全性。

GB/T 19000系列管理检测过程，实现实验记录的标准化和可追溯性。

ISO 17025确保实验室能力验证，覆盖所有检测项目的校准要求。

ASTM E3130规范差异表达统计方法，强调p值校正和多重检验控制。

GB/T 22278标准用于数据存储和共享，确保格式兼容FASTQ或BAM文件。

检测仪器

10x Genomics Chromium系统：用于单细胞捕获和文库构建，功能包括微流控芯片技术实现高捕获效率大于90%。

Illumina NovaSeq 6000测序仪：执行高通量测序，功能支持双端150bp reads生成，覆盖深度达30x以上。

Fluidigm C1单细胞分离平台：实现精确细胞分选，功能结合微流控技术确保细胞存活率大于95%。

Bio-Rad ddSEQ单细胞系统：处理文库制备，功能整合barcoding技术减少批次效应变异小于10%。

Agilent Bioanalyzer：评估RNA质量，功能通过电泳分析提供RIN值测量精度达0.1单位误差。

Thermo Fisher QuantStudio实时PCR仪：验证基因表达，功能支持qPCR检测差异表达基因的fold change验证。

NanoString GeoMx空间转录组系统：结合空间位置分析，功能整合光学成像实现细胞定位精度10μm以内。

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件