全宏基因组测序检测

因业务调整，部分个人测试暂不接受委托，望见谅。

检测项目

微生物群落多样性分析：评估样本中物种丰富度和均匀度，参数包括Shannon指数范围0-10，Simpson指数≥0.9，操作分类单元数量≥1000。

功能基因注释：识别代谢通路相关基因，参数如KEGG数据库匹配率≥95%，EC号覆盖率≥90%，注释精度误差±0.5%。

抗生素抗性基因检测：筛查样本中抗性基因存在，参数包括检出限1 copy/μg DNA，基因拷贝数范围1-10⁶，阳性检出率≥99%。

病毒组全序列组装：构建病毒基因组连续图谱，参数如contig N50长度≥10kb，组装完整性≥95%，错误率≤0.1%。

代谢潜力评估：预测微生物代谢功能，参数包括代谢途径丰度≥50条，碳氮循环基因比例0.5-2.0，功能冗余度指数≥0.8。

物种分类学分析：分类微生物至种水平，参数如分类精度≥99%，稀有物种检出率≥90%，测序深度≥50X覆盖率。

环境压力响应基因筛查：检测应激相关基因表达，参数如热休克蛋白基因丰度变化倍数≥2.0，重金属抗性基因检出限0.1ppm。

宿主-微生物互作研究：识别宿主特异性基因，参数如互作网络节点数≥100，相关性系数r≥0.8，互作强度指数0-1范围。

时间序列群落动态监测：分析微生物变化趋势，参数如时间点相关性r≥0.85，变化率标准差≤0.2，样本重复一致性≥95%。

宏基因组组装质量控制：评估序列拼接质量，参数如GC含量偏差±5%，嵌合序列率≤1%，组装错误校正精度≥98%。

致病菌风险评估：筛查病原体序列，参数如致病基因检出限0.01%，风险评估等级划分1-5级，假阳性率≤1%。

氮循环功能基因分析：量化氮代谢相关基因，参数如nifH基因拷贝数范围1-10⁵，氨氧化速率相关性r≥0.9，精度误差±0.3%。

检测范围

土壤环境样本：农田或森林土壤微生物群落研究，用于生态多样性评估和土壤健康监测。

水体样本：河流、湖泊或海洋水体微生物分析，检测水质污染指示菌和水生生态系统平衡。

人体微生物组样本：肠道、口腔或皮肤样本临床研究，适用于疾病诊断和健康状态评估。

食品工业样本：发酵产品如酸奶或酱油微生物检测，确保食品安全和发酵过程稳定性。

工业发酵罐样本：生物反应器内微生物监控，优化发酵效率和产物质量控制。

空气微生物样本：室内或室外空气悬浮粒子分析，评估空气质量和病原体传播风险。

沉积地质样本：海底或地层沉积物微生物研究，用于矿产勘探和环境变迁分析。

植物根系样本：根际微生物群落相互作用分析，提升农业产出和病害防控。

临床诊断样本：粪便或体液样本病原体筛查，支持传染病早期诊断和治疗跟踪。

极端环境样本：热泉或极地微生物适应性研究，探索生命极限和生物技术应用。

废物处理样本：垃圾填埋场或污水处理厂微生物检测，优化降解效率和环境修复。

动物肠道样本：家畜或野生动物微生物组分析，保障畜牧业健康和疾病预防。

检测标准

依据ISO 20395生物技术标准进行宏基因组高通量测序质量控制，确保数据准确性和重复性。

GB/T 34240环境微生物宏基因组检测规范，覆盖样本采集、DNA提取和序列分析全流程。

ASTM D8085沉积物宏基因组分析方法，标准化合规性验证和参数校准要求。

ISO 17640生物样本处理指南，规定无菌操作和样本保存温度-80°C条件。

GB/T 12345食品安全微生物宏基因组检测标准，设置病原体筛查阈值和报告格式。

ISO 22000食品链微生物风险管理，整合宏基因组数据用于危害分析关键点。

GB 4789食品微生物检验通则，补充宏基因组技术在成分鉴定中的应用。

ISO 17025检测实验室能力要求，规范仪器校准和数据验证流程。

ASTM E3060临床样本宏基因组分析协议，定义诊断灵敏度和特异性参数。

GB/T 33445水体微生物多样性评估标准，采用宏基因组测序量化污染指数。

检测仪器

高通量测序平台：用于生成大规模基因组序列数据，功能包括短读或长读测序，深度覆盖样本微生物群落。

自动化核酸提取系统：执行样本DNA纯化，功能确保提取效率≥98%和纯度A260/A280比值1.8-2.0。

实时定量PCR仪：检测特定基因表达水平，功能支持抗性基因定量分析，灵敏度达0.1拷贝数。

生物信息学分析工作站：运行序列比对和组装软件，功能处理原始数据生成多样性报告，误差率≤0.1%。

凝胶电泳系统：验证DNA片段大小，功能控制片段长度200bp-50kb，分辨率±5bp。

超低温冷藏设备：保存样本和试剂，功能维持-80°C环境，温度波动±1°C。

光谱分光光度计：测量DNA浓度和纯度，功能量化A260值，精度±0.01单位。

离心浓缩仪：浓缩低丰度样本，功能提升DNA回收率≥95%，处理时间≤30分钟。

检测流程

1、咨询：提品资料(说明书、规格书等)

2、确认检测用途及项目要求

3、填写检测申请表(含公司信息及产品必要信息)

4、按要求寄送样品(部分可上门取样/检测)

5、收到样品，安排费用后进行样品检测

6、检测出相关数据，编写报告草件，确认信息是否无误

7、确认完毕后出具报告正式件

8、寄送报告原件